Иоанн не поверил тогда в истинность знака, ибо он и знать не знал, о существовании подобного собора, и уж тем более, никогда там не был. Но судьба, свела его с дочерью протоиерея Кронштадтского собора, Елизаветой Несвитской. В 1855 году, был заключен их брак. Однако женщина была предупреждена о том, что Иоанн и после заключения брака, был намерен оставаться девственником. Женщина, еще до свадьбы согласилась с этим условием. Так они и прожили всю жизнь, как брат с сестрой, так и не разделив супружеского ложа.
Кронштадт того времени был местом ссылок. Туда стекались заключенные со всех уголков России. Они жили в нечеловеческих условиях, в нищете, и многие опускались. Иоанн помогал всем нуждающимся. Он раздавал милостыню, ухаживал за больными, наставлял на путь истинный опустившихся людей. Многие после беседы с ним брали себя в руки и начинали новую жизнь. В своем стремлении помогать нуждающимся, Иоанн иногда отдавал последнее, что у него было. И вот однажды, с ним произошла курьезная история. Видя такое рвение преподобного в стремлении отдать последнее людям, однажды, епархиальное начальство, запретило выдавать ему деньги, зная, что он тут же раздаст их нуждающимся.
Народ, не понимая щедрости священника, называл его юродивым и некоторые даже клеветали на него. Однако, Иоанн, не смотря ни на что, продолжал свои богоугодные дела. Обладая даром исцеления, он излечивал даже те болезни, перед которыми медицина была бессильна. Иоанн мог исцелять даже посредством телеграммы. Было даже создано особое почтовое отделение для переписки преподобного Иоанна. Зная о его даре, масса нуждающихся, со всей России, стекалась в Кронштадт. Множество людей стремилось исповедоваться святому. Конечно, он не мог выслушать каждого в отдельности. Поэтому, Иоанн предложил вести общую исповедь. Прихожане согласились, и каялись вслух, не стесняясь друг друга. Так же, во время службы, на алтарь к батюшке, клали телеграммы просящих. Иоанн, тут же, совершал молитвы за них. Присутствовал он так же и при кончине императора Александра Третьего, который умер спокойно, чувствуя облегчение от рук преподобного, возложенных на его голову.
К сожалению, в последние годы своей жизни, преподобный, сам страдал от неизлечимой болезни, но отказывался от помощи врачей и спокойно терпел муки. Скончался преподобный Иоанн в 1908 году, а позднее, Русской Православной Церковью, был установлен праздник в честь праведника Иоанна Кронштадтского. Он отмечается 2 января.