Кондратий, он же Кондрашка, по определению Владимира Даля, это паралич, нервный или кровавый удар. Иными словами - сердечный, апоплексический удар. Часто со смертельным исходом...
Кондрашка схватит - (кто-либо внезапно разбит параличом или умер)
Выражение связывается с именем предводителя Булавинского восстания на Дону в 1707 году, с Бахмутским атаманом Кондратием Афанасьевичем Булавиным ("Кондрашкой"), который внезапным налетом истребил весь царский отряд с воеводой князем Долгоруким.