Конечно. Но здесь всё зависит от того, на сколько они верующие. Если это всё доходит до фанатизма, то они вообще не станут жить вместе, если один из супругов не примет религию другого. А в остальных случаях никаких проблем на этой почве не будет. У меня достаточно знакомых, которые имеют различные религиозные принадлежности, но при этом вполне хорошо живут, просто ходят в разные храмы. Другая же знакомая просто приняла ислам, религию мужа, и так же счастливо живёт. Дело ведь не в религии, а в людях.