После смерти Сергия Радонежского, Савва принял руководство и Троицкой обителью. Когда в монастырь приехал сын Дмитрия Донского и попросил Савву организовать монастырь близ Звенигорода, преподобный не смог отказать, и около 1400 года поселился близ Звенигорода. Там он занялся строительством церкви рождества Пресвятой Богородицы. Недалеко от строящейся церкви, Савва построил хижину, куда тут же устремились желающие принять иночество. Позднее, на месте этой хижины, был возведен монастырь. До конца своей жизни Савва прожил в монастыре, где в 1407 году он и скончался. Его похоронили в церкви Рождества Пресвятой Богородицы.
После смерти преподобного Саввы, на его могиле стали происходить чудеса. Есть предание, что один монах, в результате болезни, почти лишился зрения. Он стал приходить на могилу Саввы Сторожевского и молиться об исцелении. Другой монах, видя столь искреннюю надежду, стал смеяться над слепым монахом. Однако как только больной инок прикоснулся к гробу, его глаза стали видеть, а тот, который смеялся - ослеп. В ужасе метался ослепший инок в кромешной темноте, звал на помощь, но все было бесполезно. Тогда, он бросился к гробу преподобного Саввы и услышал голос: « Ты нашел именно то, что искал. Теперь пусть, глядя на тебя, образумятся другие и не станут хулить чудес, исходящих от угодника Божия». Ослепший пришёл в ужас и стал просить прощение у преподобного. Наконец искренне раскаявшись и помолившись, инок получил исцеление.
Еще одно чудо связано с именем преподобного Саввы Сторожевского. В 1652 году, царь Алексей Михайлович охотился в Звенигородском лесу. Обогнав своих спутников, царь на некоторое время остался один. Внезапно, посреди чащи, прямо перед царем возник медведь. Лошадь, испугавшись, сбросила царя и убежала. Царь понял, что шансов на спасения практически нет, и приготовился к страшной смерти. Внезапно из чащи вышел седой старец, а медведь, увидев его, обратился в бегство. Изумленный царь спросил у своего спасителя имя. Тот назвался Саввой – иноком из Сторожевской обители.
После столь чудесного спасения, царь решил отблагодарить, спасшего его старца. Однако, не смотря на тщательные поиски, старца по имени Савва он в Сторожевской обители не нашел. Уже собравшись уходить, царь внезапно увидел икону, на которой он узнал своего спасителя. Много еще чудес связано с именем преподобного Саввы Сторожевского, который по - праву причислен церковью к лику русских святых.